Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms