Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PmpcaQ9DC61 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PmpcaQ9DC61 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms