Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde1Q9DBZ9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms