Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf6Q9DBU5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms