Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms