Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn9Q9D805 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms