Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D7E4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms