Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn23Q9D7D7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms