Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klhl40Q9D783 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms