Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf13Q9D777 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf13Q9D777 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms