Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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