Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbe1Q9D6Y9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms