Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms