Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms