Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms