Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3404Q9D506 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3404Q9D506 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms