Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms