Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4933425L06RikQ9D3Z8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms