Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms