Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tchhl1Q9D3P1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tchhl1Q9D3P1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tchhl1Q9D3P1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms