Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rufy3Q9D394 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy3Q9D394 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms