Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D2Q3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms