Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms