Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nol3Q9D1X0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms