Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Mrpl28Q9D1B9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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