Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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