Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms