Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ndufs4Q9CXZ1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ndufs4Q9CXZ1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ndufs4Q9CXZ1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ndufs4Q9CXZ1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ndufs4Q9CXZ1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ndufs4Q9CXZ1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ndufs4Q9CXZ1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndufs4Q9CXZ1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndufs4Q9CXZ1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndufs4Q9CXZ1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndufs4Q9CXZ1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndufs4Q9CXZ1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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