Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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