Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx47Q9CWX9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx47Q9CWX9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms