Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms