Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbl1Q9CWL8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ctnnbl1Q9CWL8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbl1Q9CWL8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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