Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BccipQ9CWI3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BccipQ9CWI3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms