Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms