Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sycp2Q9CUU3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp2Q9CUU3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms