Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snw1Q9CSN1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms