Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Klhl28Q9CR40 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klhl28Q9CR40 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Klhl28Q9CR40 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Klhl28Q9CR40 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Klhl28Q9CR40 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Klhl28Q9CR40 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Klhl28Q9CR40 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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