Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms