Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms