Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmed6Q9CQG0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms