Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubl4bQ9CQ84 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubl4bQ9CQ84 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms