Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Use1Q9CQ56 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Use1Q9CQ56 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Use1Q9CQ56 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Use1Q9CQ56 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Use1Q9CQ56 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Use1Q9CQ56 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Use1Q9CQ56 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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