Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp3Q9CQ10 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms