Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird2Q99NI3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms