Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl1Q99N96 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl1Q99N96 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms