Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a6dQ99N07 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms