Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf17Q99MV7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms