Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clp1Q99LI9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clp1Q99LI9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms