Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms