Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reep3Q99KK1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms